123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1867 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  45.45 
 
 
184 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  50.39 
 
 
197 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  42.19 
 
 
172 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  42.19 
 
 
172 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  47.62 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  44.66 
 
 
172 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  46.08 
 
 
185 aa  92  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  44 
 
 
158 aa  90.5  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  45.54 
 
 
173 aa  89.4  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  44.95 
 
 
165 aa  85.1  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  33.61 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  41.94 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  39.8 
 
 
171 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  40.37 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  33.02 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  33.02 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  39.45 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  33.64 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  35.51 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  31.78 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  34.58 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  31.86 
 
 
129 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  29.29 
 
 
120 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  38.14 
 
 
138 aa  62.4  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  31.45 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  34.02 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  33.65 
 
 
131 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.36 
 
 
132 aa  58.2  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  28.95 
 
 
220 aa  57.8  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  31.62 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  32.38 
 
 
185 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.97 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  36.17 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  36.08 
 
 
195 aa  57  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  29.91 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  34.92 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  32.04 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  30.08 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  32.69 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  31.07 
 
 
164 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  37.38 
 
 
136 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.81 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  33.64 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  30.89 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  29.63 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  38.64 
 
 
138 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  29.75 
 
 
139 aa  54.3  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  32.23 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.93 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  38.64 
 
 
136 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  29.91 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.66 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  29 
 
 
125 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  28.93 
 
 
138 aa  51.2  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  43.42 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  35.23 
 
 
142 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  35.23 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  35.23 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  31.96 
 
 
125 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  27.88 
 
 
131 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  36.73 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.85 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  30.63 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  27.93 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  26.61 
 
 
134 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  30.08 
 
 
133 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  29.31 
 
 
133 aa  47.8  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  29.17 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.19 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.19 
 
 
132 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  29.5 
 
 
191 aa  47.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  31.91 
 
 
168 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  47.4  0.00008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  28.33 
 
 
140 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  31 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  29.7 
 
 
278 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  30.89 
 
 
228 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  29.9 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30.84 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  26.55 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  30.84 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  29.59 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  29.21 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  25.81 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  25.41 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  29.21 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  25.44 
 
 
224 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  29.11 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  32.32 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  34.52 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  25.45 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  26.85 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>