158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2564 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  251  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  37.29 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  36.28 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  40.2 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  40 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  34 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  38 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  34.86 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  36 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  34.23 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  32.73 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  30.91 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  32 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  35.35 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  34.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  37.37 
 
 		 131 aa  66.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  33.04 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  31.82 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  32.74 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  31.73 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  36.26 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  34.82 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  31.78 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  31.5 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  29.59 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  33.64 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  29.84 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  33.07 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  37.23 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  34.71 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  27.94 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  35.58 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  28.18 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.78 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  35.58 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  36.73 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  35.58 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  32.69 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  37.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.7 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  29.91 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  33.64 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  25.56 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  34.41 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  25.56 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  34.62 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  29.77 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  30.77 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  28.71 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  28.71 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  28.87 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  28.71 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  27.35 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  29.57 
 
 		 123 aa  57  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  27.35 
 
 		 134 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  26.36 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.41 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  24.77 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  31.4 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  31.58 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  32.67 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  28.7 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  32.98 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  30.25 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  31.93 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  27.62 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  34.74 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  30.47 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  26.5 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  30.25 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.64 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  34.34 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  32.22 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  27.52 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  28.7 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.87 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  27.62 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  27.52 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  27.62 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  27.45 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  26.85 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>