64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1707 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  274  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  34.43 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  32.04 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  35 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  39 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  33.98 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  34.34 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  34.34 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  38 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  34.34 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  38 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.82 
 
 
202 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  38 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  32.32 
 
 
185 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  32.32 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  32.32 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  34.74 
 
 
195 aa  55.5  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  32.32 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  31.09 
 
 
195 aa  55.1  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  32.29 
 
 
154 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  30.7 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  30.91 
 
 
139 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  26.67 
 
 
218 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  27.84 
 
 
138 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  25.23 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.91 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.84 
 
 
134 aa  47  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  23.53 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  25 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  30.15 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
179 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  24 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  32.29 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  22.73 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  25.25 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.85 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  28.28 
 
 
132 aa  44.3  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  29.13 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  28.43 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  27.52 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  31.37 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  25 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  27.85 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  25.89 
 
 
187 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  25.22 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  26.09 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  24.14 
 
 
136 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  27.55 
 
 
115 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  32.17 
 
 
118 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.06 
 
 
152 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
203 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  23.28 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  23.42 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
199 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>