29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4993 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  274  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1559  hypothetical protein  88.89 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.443609  normal  0.88306 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  45.35 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  39.53 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  35.71 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  36.19 
 
 
164 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  35.48 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  32.69 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  28.85 
 
 
150 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  34.29 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  34.29 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  34.29 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  30.61 
 
 
129 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  29.52 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  30.1 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  45.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  34.95 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  34.95 
 
 
143 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  38.03 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  30.23 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 
154 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  33.98 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  30.59 
 
 
141 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  28.42 
 
 
133 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>