144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0736 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  266  7e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  48.03 
 
 
131 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  46.85 
 
 
134 aa  103  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  49.51 
 
 
131 aa  97.8  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  49.51 
 
 
131 aa  97.1  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  39.29 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  41.75 
 
 
130 aa  87.4  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  44.33 
 
 
154 aa  87  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  37.6 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  37.12 
 
 
183 aa  80.1  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  36.36 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  48.31 
 
 
118 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  36.84 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  35.61 
 
 
183 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  32.76 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  31.93 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  33.33 
 
 
122 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  37.27 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  34.15 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  32.2 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.82 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  40.91 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  34.38 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  38.3 
 
 
202 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  40.59 
 
 
138 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  32.73 
 
 
184 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  36.27 
 
 
197 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  34.38 
 
 
158 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  34.74 
 
 
125 aa  57.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.07 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  34.31 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  31.19 
 
 
154 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  30.08 
 
 
159 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  29.82 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  36.17 
 
 
173 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  32.63 
 
 
218 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  34.38 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  32.46 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  29.82 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  29.82 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  28.28 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  28.28 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  29.25 
 
 
172 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  28.42 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  31.53 
 
 
144 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.32 
 
 
106 aa  53.5  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  27.64 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  29.25 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  32.17 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  33.67 
 
 
191 aa  52.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  29 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  29.25 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  28.8 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  34.02 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.43 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  35.51 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  28.12 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
187 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  25.24 
 
 
185 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
123 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  37.38 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  27.66 
 
 
282 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  34.69 
 
 
128 aa  50.8  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  31.58 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 
195 aa  50.8  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  33.64 
 
 
184 aa  50.4  0.000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  38.54 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  27.91 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  32 
 
 
191 aa  50.1  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  31.03 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  35.05 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  30 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  26.23 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  28.7 
 
 
278 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.13 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.4 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  26.09 
 
 
135 aa  48.9  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  35.05 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.6 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  25.53 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  35.05 
 
 
179 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  31.18 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  26.61 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  26.12 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  33.67 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.6 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  32.99 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  24.55 
 
 
171 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  27.87 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  23.36 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>