83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1567 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  234  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  48.31 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  43.18 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  41.57 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  48.15 
 
 
131 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  41.18 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  40.7 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  48.15 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  46.91 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  34.48 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  41.25 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  38.16 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  37.93 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
183 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  33.73 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  34.18 
 
 
183 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  34.07 
 
 
202 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  35.44 
 
 
102 aa  54.3  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  28.1 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  32.18 
 
 
195 aa  53.9  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  28.05 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  35.8 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.91 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.93 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  34.62 
 
 
191 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30.97 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  36.84 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  35.23 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  29.49 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  29.03 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  33.98 
 
 
184 aa  48.9  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  32.67 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  28 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  35 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  26.32 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  30.38 
 
 
197 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  30.12 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  29.67 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  30.12 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  34.94 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  30.12 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  30.49 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  30.49 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  32.14 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  30.49 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  25.25 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  34.18 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  27.16 
 
 
125 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  30.38 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  26.14 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 
148 aa  44.3  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  25 
 
 
178 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  28.24 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  29.52 
 
 
265 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  25.61 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  29.07 
 
 
141 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  29.76 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  25 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  25.61 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  34.15 
 
 
282 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  24.56 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  26.97 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  24.73 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  24.56 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  24.56 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  31.43 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  26.97 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  34.67 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  26.74 
 
 
132 aa  42  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  32.17 
 
 
138 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  30.59 
 
 
203 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  32.81 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  28.41 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  24.68 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  24.68 
 
 
148 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  21.24 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
122 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
122 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>