62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04806 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  100 
 
 		 102 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001075  Ccm2-related protein  72.37 
 
 		 76 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.150735  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  46.91 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  38.14 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  55.17 
 
 		 154 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  40.91 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  43.94 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  38.46 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  35.21 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  29.41 
 
 		 228 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  32.94 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  41.54 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  32.94 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  32.94 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  32.56 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  35.44 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  29.47 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  33.73 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  28.21 
 
 		 265 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  36.11 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  31.82 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  37.8 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  37.8 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  37.14 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  31.82 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  28.05 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  30.12 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.26 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  34.29 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  34.29 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  35.48 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  35.71 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.41 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.43 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.88 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  34.38 
 
 		 223 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.48 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  32.89 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  28.89 
 
 		 282 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  30.65 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  32 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.15 
 
 		 202 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  30.67 
 
 		 173 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  33.87 
 
 		 134 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  37.1 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  30.16 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  30 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  29.23 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  33.87 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  32.39 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  31.51 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.38 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>