108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1996 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  456  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  49.62 
 
 
125 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  43.33 
 
 
166 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  36.73 
 
 
183 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  37.5 
 
 
130 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  36.73 
 
 
183 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  30.52 
 
 
154 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30.77 
 
 
157 aa  84.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  42 
 
 
282 aa  77  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  43.18 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  39.5 
 
 
131 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  39.18 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  33.93 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  34.48 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  39.36 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  38.3 
 
 
131 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  41.58 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  33.05 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  30.87 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  30.87 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  30.87 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  30.19 
 
 
147 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  35.11 
 
 
137 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  31.13 
 
 
148 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  31.13 
 
 
148 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  31.37 
 
 
135 aa  62.4  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  62.4  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
149 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  32.58 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  35.92 
 
 
145 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  33.63 
 
 
151 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  39.18 
 
 
143 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 
267 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  34.65 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  34.65 
 
 
269 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  34.75 
 
 
128 aa  59.7  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  39.18 
 
 
139 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  32.67 
 
 
141 aa  59.3  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.29 
 
 
138 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  34.34 
 
 
131 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  29.81 
 
 
132 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  33.66 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  35.64 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.9 
 
 
131 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  29.41 
 
 
102 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 
106 aa  56.6  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 
125 aa  56.6  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  35.78 
 
 
138 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  34.65 
 
 
173 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  34.55 
 
 
171 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  33.66 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  33.66 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  32.43 
 
 
135 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  32.29 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  29.9 
 
 
161 aa  52  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  32.29 
 
 
145 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  27.84 
 
 
178 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  32.2 
 
 
137 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  25.87 
 
 
185 aa  48.9  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  26.92 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  29.79 
 
 
168 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  29.25 
 
 
123 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  29.7 
 
 
131 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  28.04 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  27.68 
 
 
149 aa  47.4  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  28.04 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  28.04 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  22.96 
 
 
196 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  31.31 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  30.89 
 
 
159 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  32.56 
 
 
202 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  28.09 
 
 
119 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.71 
 
 
147 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  25.77 
 
 
162 aa  46.6  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  35.56 
 
 
184 aa  46.6  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  28.97 
 
 
148 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  29.17 
 
 
164 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  29.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  24.55 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  30.2 
 
 
148 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  26.23 
 
 
160 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 
157 aa  45.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.47 
 
 
148 aa  45.4  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  26.67 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  27.36 
 
 
150 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  31.31 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  23.96 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  26.67 
 
 
132 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  26.09 
 
 
138 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  27.59 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  30.93 
 
 
220 aa  43.9  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  28.05 
 
 
119 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  25.81 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>