136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1088 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  339  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  70.62 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  70.62 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  72.08 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  67.06 
 
 		 185 aa  208  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  62.57 
 
 		 165 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  77.24 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  47.1 
 
 		 197 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  48.57 
 
 		 184 aa  121  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  39.31 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  37.67 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  36.28 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  36.61 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  33.79 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  27.56 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  38.78 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.85 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  38.71 
 
 		 202 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.78 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  35.58 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  32.38 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  31.03 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  33.02 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  31.62 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  31.9 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  28.26 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  31.48 
 
 		 134 aa  62  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30.3 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  30.77 
 
 		 119 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  35.11 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  30.89 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  29.91 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  32.73 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  33.64 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.66 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  32.23 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  28.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  37.21 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  34 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  35.85 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  31.54 
 
 		 152 aa  57  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  27.93 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  28.44 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  31.19 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.62 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.63 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  36.27 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  29.17 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  38.38 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  27.52 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  33.73 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.41 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.17 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  31.19 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  25.41 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  31.96 
 
 		 138 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.06 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  26.09 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  26.81 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  29 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  28.57 
 
 		 141 aa  51.6  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 		 136 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  29.59 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 		 136 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  30.59 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  30.53 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.67 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  30.59 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  32.97 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29.89 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  32.65 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  29.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  29.03 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  28.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  23.17 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  23.17 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  23.12 
 
 		 223 aa  48.9  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  32.73 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  32.73 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  28.72 
 
 		 278 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  25.71 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.79 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  28.71 
 
 		 153 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  25.71 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  25.74 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  22.43 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>