149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4474 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  70.67 
 
 		 172 aa  206  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  70.67 
 
 		 172 aa  206  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  70.75 
 
 		 172 aa  205  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  62.5 
 
 		 185 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  63.06 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  70.63 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  54.55 
 
 		 197 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  50.85 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  47.62 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  41.61 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  35.77 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  38.67 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  35.04 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  38.05 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  37.89 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  31.14 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  35 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  34.31 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  36.84 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  34.31 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  31.58 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  29.63 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  30 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  34.95 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  31.62 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  30.21 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  35.42 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  30.69 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  32.38 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  33.98 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  33.01 
 
 		 119 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  32.58 
 
 		 133 aa  57.4  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  26.05 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  39.08 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.82 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  32.67 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  35.35 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  36 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  29.7 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  33.02 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  34.31 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  32.11 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  27.36 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.76 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  28.97 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  29.32 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.71 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  32.22 
 
 		 148 aa  52  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  27.45 
 
 		 220 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 		 203 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  31.07 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  26.42 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.76 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  34.02 
 
 		 133 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 218 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  27.86 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  32.65 
 
 		 137 aa  50.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  27.86 
 
 		 223 aa  50.8  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  34.86 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  25.56 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  32 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  25.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  25.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  25.69 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  31.13 
 
 		 121 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  25.21 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.67 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  29.7 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  34.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  34.86 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  32.38 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  25.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  34.04 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  27.12 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 		 122 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  32.38 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  27.37 
 
 		 145 aa  47.8  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.53 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  36.79 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  33.33 
 
 		 102 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>