84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4050 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  236  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  74.04 
 
 
132 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  74.04 
 
 
132 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  71.29 
 
 
134 aa  144  5e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  70.87 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  58.49 
 
 
134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  58.65 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  60.95 
 
 
140 aa  118  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  57.69 
 
 
134 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  58.1 
 
 
133 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  53.85 
 
 
150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  58.82 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  57.95 
 
 
164 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  56.32 
 
 
153 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  43 
 
 
152 aa  90.5  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  44 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  48.24 
 
 
129 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  42.53 
 
 
144 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  40.45 
 
 
148 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  44.94 
 
 
140 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  41.86 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  44.94 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  37.5 
 
 
148 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  41.67 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  44.71 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  44.05 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  44.05 
 
 
145 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  43.53 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  37.65 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  40.48 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  36.78 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  38.61 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  28.09 
 
 
184 aa  53.9  0.0000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  33.73 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  33.7 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  33.7 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  39.02 
 
 
184 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  33.73 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  31.37 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  32.14 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  34.78 
 
 
187 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  32.94 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  35.71 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  33.72 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.49 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  32.53 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.49 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.49 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  32.53 
 
 
142 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  32.53 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  26.72 
 
 
223 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 
348 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  30.95 
 
 
172 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.76 
 
 
131 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  34.94 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.12 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  25.56 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  35.8 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  29.35 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  35.48 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  32.94 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  31.76 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  30.49 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  28.24 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  31.71 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  25.56 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.85 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  29.76 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  30.12 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  26.26 
 
 
137 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  24.51 
 
 
183 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  32.53 
 
 
196 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  47.22 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  28.09 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  27.27 
 
 
133 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  35.23 
 
 
146 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  23.53 
 
 
183 aa  40  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>