100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0746 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  50 
 
 		 184 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  51 
 
 		 184 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  49.54 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  50 
 
 		 184 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  51.52 
 
 		 186 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  40.26 
 
 		 171 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  48.18 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  46.53 
 
 		 221 aa  98.2  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  48.45 
 
 		 185 aa  97.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  43.93 
 
 		 185 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  45.45 
 
 		 189 aa  95.1  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  34.97 
 
 		 247 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  43.27 
 
 		 224 aa  91.7  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  43.88 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  44.63 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  29.71 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  31.82 
 
 		 150 aa  62  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  36 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  37.36 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  32.98 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  37.5 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  24.6 
 
 		 133 aa  52.4  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  26.19 
 
 		 148 aa  52  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  25.51 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  25.51 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  34.94 
 
 		 148 aa  52  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.97 
 
 		 139 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  35.85 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  35.85 
 
 		 262 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  34.45 
 
 		 133 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  31.19 
 
 		 153 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  27.56 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  31.86 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  37.5 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  31.86 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  31.86 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.63 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  25.53 
 
 		 131 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  28.85 
 
 		 173 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.69 
 
 		 131 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  35.23 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  30.1 
 
 		 135 aa  48.5  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  28 
 
 		 133 aa  48.9  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.63 
 
 		 131 aa  48.5  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  27.96 
 
 		 131 aa  48.5  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  24.79 
 
 		 160 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 		 134 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  26.36 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  26.72 
 
 		 118 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  28.95 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  27.36 
 
 		 119 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.28 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 119 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.96 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  39.18 
 
 		 131 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  25.56 
 
 		 161 aa  46.6  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  30.17 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  30.61 
 
 		 133 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  27.88 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  29 
 
 		 129 aa  45.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  45.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  33.87 
 
 		 131 aa  45.1  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  31.25 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  28 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  24 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.11 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  25.81 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  24 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  25.21 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  25.25 
 
 		 199 aa  44.3  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  23.48 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  22.68 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  25.53 
 
 		 134 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.43 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  25.78 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  30.69 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  34.38 
 
 		 102 aa  43.5  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  25.47 
 
 		 115 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  30.85 
 
 		 139 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  32.98 
 
 		 265 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  27.08 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  27.27 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  32.08 
 
 		 128 aa  42  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  30.85 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>