127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1175 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 185 aa  362  1e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  73.33 
 
 		 172 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  73.03 
 
 		 172 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  73.03 
 
 		 172 aa  214  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  70.13 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  63.4 
 
 		 165 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  78.57 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  43.09 
 
 		 197 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  40.61 
 
 		 184 aa  118  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  46.08 
 
 		 159 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  42.06 
 
 		 158 aa  85.1  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  42.24 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  39.39 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  35.51 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  32.89 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  37.25 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  37.25 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  33.55 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  35.29 
 
 		 119 aa  65.1  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  39.78 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.63 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  35 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  37.04 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.98 
 
 		 131 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  28.22 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  34.29 
 
 		 116 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  37.74 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.97 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  33.65 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  30.08 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  36.04 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  28.93 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  27.73 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  30.34 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.51 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  32.32 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  33.61 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  33.62 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  28.7 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  33.9 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  34.69 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  28.7 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  28.7 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  34.91 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  25.23 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  29.25 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  34.91 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  34.91 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  28.7 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  35.9 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  34.26 
 
 		 138 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.28 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  31.58 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  31.29 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  27.97 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28.85 
 
 		 157 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 		 134 aa  51.6  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  38.2 
 
 		 161 aa  52  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  31.62 
 
 		 168 aa  51.6  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  32.5 
 
 		 150 aa  51.6  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.21 
 
 		 122 aa  51.2  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 		 134 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  27.62 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.12 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  34.29 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  27.08 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  29.47 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  27.08 
 
 		 131 aa  49.3  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  25.87 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  29.17 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  32.04 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  35.79 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  35.79 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  29.81 
 
 		 121 aa  48.5  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  35.79 
 
 		 140 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  28.43 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  35.71 
 
 		 118 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  30.69 
 
 		 134 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  26.79 
 
 		 148 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  30.19 
 
 		 132 aa  47.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  31.4 
 
 		 278 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  25.89 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  26.73 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  27.73 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  28.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  28.29 
 
 		 164 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  31.68 
 
 		 153 aa  45.1  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  25.89 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  34.44 
 
 		 113 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  24.68 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>