104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0024 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  259  8e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  33.61 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  36.11 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  36.84 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  35.04 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  35.64 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  33.68 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  36.73 
 
 		 173 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  30.85 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  31.13 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  31.13 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  32.65 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  31.63 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  32.8 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  29.91 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  31.07 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  29.9 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  27.05 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  24.43 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  32.08 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  31.11 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.19 
 
 		 202 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  27.55 
 
 		 139 aa  52  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  28.12 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.1 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  31.68 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  32.38 
 
 		 152 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  35.19 
 
 		 121 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  34.21 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 185 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  32 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  32 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  30.93 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  35.37 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  25.77 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  25.53 
 
 		 223 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3215  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  26 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  29.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  31.58 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  32.99 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.42 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  27.78 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  32.89 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  26.8 
 
 		 224 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  28.72 
 
 		 220 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  31.76 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 		 148 aa  47  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  27.78 
 
 		 185 aa  47  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  32.58 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  28.85 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  27.97 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  25.98 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  26.02 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  32.58 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  32.58 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  25.96 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  27.59 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  27.08 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  28.12 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  26.61 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  29.51 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  27.55 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  25.51 
 
 		 145 aa  43.5  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  29.59 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  27.55 
 
 		 228 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  32.89 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  25.96 
 
 		 153 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  27.18 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  28.21 
 
 		 184 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  27.64 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  26.4 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  25.49 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  30.34 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  28.18 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  25.64 
 
 		 186 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  27.64 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  25.96 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  25.33 
 
 		 278 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  27.64 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  29.03 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  25.74 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  28.89 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>