60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1308 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 162 aa  315  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  62.33 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  37.68 
 
 		 171 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  46.46 
 
 		 186 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  39.72 
 
 		 185 aa  84.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  43.88 
 
 		 223 aa  84.7  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  41.82 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  43.24 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  45 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  45 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  39.66 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  36.97 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  37.84 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  30.07 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  35.35 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  36.63 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  30.61 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  26.47 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  25.74 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  33.66 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.18 
 
 		 125 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  24.26 
 
 		 191 aa  50.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  25.77 
 
 		 228 aa  50.4  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  30.61 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  27.2 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  28.72 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  32.93 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  24.76 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  25.26 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  23.33 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  23.47 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  23.47 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  23.47 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  26.02 
 
 		 218 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  22.68 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  28.12 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  23.88 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  23.96 
 
 		 166 aa  44.3  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  21.43 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  25.84 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  29.01 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  25.84 
 
 		 269 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  27.27 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  25.84 
 
 		 270 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1453  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  42  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  24.58 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  25.47 
 
 		 183 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  23.4 
 
 		 141 aa  41.2  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  25.74 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  22.88 
 
 		 173 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.49 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  25.74 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  24.51 
 
 		 134 aa  40.8  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  23.4 
 
 		 282 aa  40.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>