58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2201 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  207  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  37.36 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  32.95 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  31.91 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  33.66 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  34.18 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  34.18 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  35.44 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.72 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  32.95 
 
 		 247 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  32.58 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  34.18 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  31.73 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  34.94 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  34.18 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  29.59 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  28.89 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  30.85 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  32.58 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  30.53 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  31.31 
 
 		 147 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  32.5 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  29.59 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  29.59 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  29.59 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  28.28 
 
 		 151 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  30.38 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  29 
 
 		 218 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  32.5 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  29.7 
 
 		 269 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  29.7 
 
 		 270 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  30.69 
 
 		 278 aa  43.5  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  28.71 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  28.71 
 
 		 262 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  32.91 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  29.7 
 
 		 267 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  32 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  30.85 
 
 		 137 aa  42.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  26.47 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  27.37 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  28.72 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  26.17 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  32.97 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  31.18 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  27.37 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.47 
 
 		 152 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  33.68 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  29.35 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  25.25 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  25.3 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  34.55 
 
 		 164 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  32.63 
 
 		 139 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>