70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0840 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  566  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  49.44 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  49.06 
 
 		 262 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  49.45 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  46.52 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  47.46 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  59.75 
 
 		 173 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  58.93 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  48.89 
 
 		 265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  50.98 
 
 		 171 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  50.51 
 
 		 135 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  51.96 
 
 		 131 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  48.6 
 
 		 151 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  53.06 
 
 		 138 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  48.04 
 
 		 141 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  43.14 
 
 		 149 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  43.14 
 
 		 149 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  43.14 
 
 		 149 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  43.14 
 
 		 149 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  43.88 
 
 		 137 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  36.36 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  37.76 
 
 		 147 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  36.73 
 
 		 135 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  32.63 
 
 		 183 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  35.11 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  33.66 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  32.71 
 
 		 131 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  31.91 
 
 		 159 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 		 187 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  36.99 
 
 		 125 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  32.32 
 
 		 131 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  32.41 
 
 		 131 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  34.38 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  35.53 
 
 		 203 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  32.32 
 
 		 131 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  27 
 
 		 196 aa  49.7  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.77 
 
 		 134 aa  49.3  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.53 
 
 		 138 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  28.7 
 
 		 137 aa  48.9  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  29.79 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  35.23 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  27.97 
 
 		 220 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  32.99 
 
 		 113 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.7 
 
 		 159 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 		 123 aa  46.6  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.45 
 
 		 139 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  30.39 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  30.39 
 
 		 210 aa  45.8  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  29.13 
 
 		 149 aa  45.8  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  28.72 
 
 		 173 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  31.4 
 
 		 185 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  28.07 
 
 		 131 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.12 
 
 		 145 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  30.39 
 
 		 223 aa  45.4  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  27.66 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  27.66 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  26.92 
 
 		 122 aa  44.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.72 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  24.49 
 
 		 199 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  27.66 
 
 		 172 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  31.87 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  30.69 
 
 		 109 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3755  hypothetical protein  52.5 
 
 		 58 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  28 
 
 		 138 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>