66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2226 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  63.16 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  63.16 
 
 		 135 aa  138  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  60.53 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  55.38 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  56.64 
 
 		 282 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  49.15 
 
 		 137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  50 
 
 		 265 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  46.09 
 
 		 147 aa  106  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  50.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  50.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  50.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  50.48 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  53.06 
 
 		 278 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  103  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  44.35 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  44.35 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  45.22 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  43.55 
 
 		 262 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  43.55 
 
 		 262 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  49 
 
 		 269 aa  97.4  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  49 
 
 		 267 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  49 
 
 		 270 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  39.47 
 
 		 119 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  48 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  32.87 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  30.85 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.85 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  35.78 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  26.81 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.85 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  31.68 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  32.43 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 		 199 aa  48.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  32.91 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  26.12 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.71 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.37 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.46 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  23.13 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  26.19 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  32.97 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  27.07 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.44 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.73 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.99 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.46 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  29.41 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  28.95 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  24.75 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  29.81 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  27.37 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  30.77 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  25.74 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  32.29 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  32.29 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  32.29 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  32.43 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  25.83 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  28.71 
 
 		 131 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  24.53 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  27.37 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  29.89 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  26.53 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  25.98 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>