67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0706 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  342  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  57.28 
 
 
265 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  44.59 
 
 
262 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  44.59 
 
 
262 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  57.84 
 
 
267 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  57.84 
 
 
270 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  57.84 
 
 
269 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  56.86 
 
 
173 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  50.98 
 
 
278 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  49.02 
 
 
282 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  47.12 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  46.73 
 
 
135 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  47.57 
 
 
131 aa  104  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  44.23 
 
 
141 aa  103  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  45.22 
 
 
138 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  46.3 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  46.3 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  46.3 
 
 
149 aa  95.5  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  46.3 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  38.66 
 
 
148 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  38.66 
 
 
148 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  38.26 
 
 
147 aa  90.9  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  37.96 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  39.81 
 
 
137 aa  89  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  34.58 
 
 
119 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  31.63 
 
 
187 aa  62  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  29.17 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.17 
 
 
220 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  29.66 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  24.84 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  26.55 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  34.55 
 
 
228 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  28.72 
 
 
183 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.3 
 
 
134 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 
203 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  29.52 
 
 
131 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  29.29 
 
 
131 aa  51.2  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  27.59 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  31.82 
 
 
102 aa  48.9  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  25.22 
 
 
154 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  24.55 
 
 
137 aa  47.8  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  24.21 
 
 
122 aa  47.8  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  26.77 
 
 
157 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  29.91 
 
 
223 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  26.45 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  28.09 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  24.77 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  28.57 
 
 
125 aa  45.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  30 
 
 
191 aa  44.7  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.09 
 
 
131 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  28.97 
 
 
144 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  28.3 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  26.92 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  26.96 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  22.77 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  27.52 
 
 
134 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  25.44 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  26.45 
 
 
153 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  26.67 
 
 
121 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  24.77 
 
 
134 aa  40.8  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  27.66 
 
 
168 aa  40.8  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  24.77 
 
 
134 aa  40.8  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  26.36 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>