121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2189 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  64.15 
 
 		 113 aa  146  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  58.41 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  54.72 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  40.2 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  37.25 
 
 		 185 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  38.18 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  38.18 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  37.27 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  36.79 
 
 		 147 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  39 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  39 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  39 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  44.19 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  35.51 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  34.38 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  33.96 
 
 		 184 aa  66.2  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  32.04 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  36.63 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  34.95 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  35.85 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.85 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  29.41 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  38.14 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  36.04 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  35.24 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  35 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  31.53 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  29.9 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.93 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  28.97 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  28.83 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  36.08 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.39 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  36.08 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.67 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  34.29 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  30.48 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  31.07 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  32.69 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  36.08 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  28.28 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.52 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1066  protein of unknown function DUF583  27.03 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  28.42 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 203 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  27.55 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  27.66 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  31 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  26.36 
 
 		 282 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  27.55 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  27.78 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  25.21 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  27.1 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  26.73 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  29.35 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  25.81 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  33.7 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  29.29 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  23.08 
 
 		 196 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  26.37 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  30.69 
 
 		 180 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  28.26 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  32.63 
 
 		 116 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  30.69 
 
 		 179 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  28.26 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  31.33 
 
 		 129 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.12 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.84 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  26.53 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  29.03 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  27.66 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  25.89 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  26.53 
 
 		 202 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  26.53 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  27.06 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 		 183 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  27.84 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  23.3 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  29.17 
 
 		 166 aa  43.9  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  27.18 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  31.76 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>