109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1382 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  74.4 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  74.4 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  74.4 
 
 		 149 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  74.4 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  70.87 
 
 		 148 aa  186  9e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  70.31 
 
 		 147 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  70.87 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  68.99 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  47.58 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  47.15 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  46.55 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  51.33 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  49.15 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  48 
 
 		 262 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  48 
 
 		 262 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  48.48 
 
 		 270 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  48.48 
 
 		 269 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  48.48 
 
 		 267 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  46.46 
 
 		 282 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  41.28 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  48.48 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  45.45 
 
 		 265 aa  93.6  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  39.81 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  43.88 
 
 		 278 aa  87.4  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  35.29 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  36.08 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  30.85 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  35.11 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.85 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  35.05 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  29.46 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  31.9 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  24.39 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.36 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  34.65 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  30.97 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  30.97 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  30.97 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.91 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  33.64 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  26.47 
 
 		 172 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  34.62 
 
 		 223 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  26.47 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  26.47 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  23.89 
 
 		 199 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  25.62 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  28.16 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  26.26 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  26.32 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  27.37 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  30.51 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  28.87 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  27.37 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  25.55 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  25.55 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30.61 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  25.19 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  31.3 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  28.42 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  26.6 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30.17 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  27.1 
 
 		 220 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  23.28 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  31.53 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  27.83 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  31.13 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  31.9 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  26.96 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  26.96 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  26.13 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  26.8 
 
 		 191 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  27.66 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  26.04 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.88 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.72 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.5 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  25.26 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  27.12 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  27.12 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  22.06 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  30.85 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  22.06 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  25.61 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  22.61 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  22.73 
 
 		 247 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  22.76 
 
 		 202 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 		 187 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  26 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  26.17 
 
 		 139 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  26.32 
 
 		 148 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>