46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2505 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  261  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  35.14 
 
 
191 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  36.25 
 
 
131 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  32.93 
 
 
196 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  30.95 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  31.82 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  31.82 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  32.47 
 
 
195 aa  47  0.00009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  33.75 
 
 
148 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  36.62 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  29.17 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  31.33 
 
 
115 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  38.81 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  29.17 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  29.07 
 
 
185 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.94 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  33.75 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  35.21 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  34.52 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.59 
 
 
138 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  34.12 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  32.39 
 
 
135 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  30.23 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  30.23 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  30.23 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  32.14 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  27.78 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  30.23 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  25.61 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  27.71 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  31.65 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  26 
 
 
132 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  30.16 
 
 
129 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  29.87 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  34.57 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  30.12 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  30.34 
 
 
184 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  32.86 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.52 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  27.78 
 
 
278 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  28.24 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  28.57 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>