129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0653 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  255  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  46.67 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  48.33 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  39.84 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  43.22 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  42.19 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  43.22 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  43.22 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  44.07 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  45.76 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  44.35 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  41.94 
 
 		 154 aa  95.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  42.74 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  42.64 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  44.07 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  44.54 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  34.75 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  38.52 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  38.52 
 
 		 145 aa  87  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  39.5 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  36.36 
 
 		 148 aa  84.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  38.71 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  38.71 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  36.21 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  39.5 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  48.24 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  45.65 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  35.25 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  34.43 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  32.03 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  36.04 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  34.86 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  34.31 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  29.91 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  33.63 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  36.04 
 
 		 113 aa  66.6  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  34.31 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  39.78 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  34.31 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  34.31 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  30.89 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  31.86 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  35.85 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  32.2 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.17 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  28.93 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  26.21 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  27.68 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.69 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.1 
 
 		 139 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  32.38 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  30.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  30.1 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  38.46 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  33.65 
 
 		 116 aa  57  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  35.85 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  27.27 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  26.5 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  29.82 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  32.32 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.69 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  32.11 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  32 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  29.82 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  32.41 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.52 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  29.82 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.68 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  29.82 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  25.64 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  31.43 
 
 		 196 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  36.73 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  34.29 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4992  hypothetical protein  26.89 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.536213  normal  0.0456371 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  30.43 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  30.61 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  26.55 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  33.66 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  26.19 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  27.93 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  30.34 
 
 		 148 aa  46.2  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  27.78 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  30.63 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  29.35 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  25.74 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  22.55 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  25.44 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  22.55 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>