111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0062 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  50 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  41.94 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  36.73 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  36.73 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  35.92 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  37.14 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  36.73 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  36.17 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  34.65 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  33.91 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  37.63 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  37.63 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  37.63 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  32.38 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  40.59 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  38.61 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  37.5 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  33.64 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  34.29 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  37.61 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  37.89 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  37.61 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  35.59 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  37.61 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  33.65 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  36.79 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 		 154 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  36.79 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  34.95 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  36.36 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  27.35 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  34.62 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  31.25 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  37.36 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  34.74 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  38.61 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  33.96 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  30.28 
 
 		 183 aa  53.9  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  34.86 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.28 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  36.47 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  36.17 
 
 		 202 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  36.96 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  38.71 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  32 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  28.95 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  33.72 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  29.17 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 		 113 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  35.58 
 
 		 148 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  31.03 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3215  hypothetical protein  32.69 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  28.43 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  32.98 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.56 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  31.31 
 
 		 158 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  33.73 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  32.63 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1453  hypothetical protein  35.11 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  27.91 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  29.13 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  27.91 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  28.28 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  35.21 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  28.18 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  26.92 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  32.63 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  25.66 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  34.29 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  29.9 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  26.6 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  21.7 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  30.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  32.46 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  31.25 
 
 		 218 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  28.04 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  36.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  29.9 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  27.37 
 
 		 265 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  32.93 
 
 		 228 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  29.9 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>