103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1052 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  256  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  57.84 
 
 
148 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  42.97 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  38.28 
 
 
161 aa  89  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  42.42 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  35.45 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  37.89 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  34.31 
 
 
143 aa  64.3  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  34.31 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  33.07 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  34.62 
 
 
151 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  31.62 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  32.41 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  28.7 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  32.43 
 
 
125 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  31.4 
 
 
145 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  34.07 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  31.31 
 
 
128 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  32.11 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  29.82 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  35.48 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.47 
 
 
116 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  32.04 
 
 
164 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.84 
 
 
138 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  34.07 
 
 
157 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  28.97 
 
 
136 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  31.19 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.84 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.84 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  32.58 
 
 
132 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  32.61 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  31.19 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  31.87 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  31.68 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  31.73 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  32.95 
 
 
282 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
195 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  31.87 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  31.87 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  27.88 
 
 
185 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  28.12 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.24 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  31.53 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  33.94 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.27 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  31.13 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  33.68 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.27 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  32.97 
 
 
138 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  31.91 
 
 
131 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  26.42 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  30.23 
 
 
195 aa  45.8  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  29.73 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  31.68 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  30.34 
 
 
223 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  23.77 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  31.91 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  31.76 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  33.33 
 
 
184 aa  45.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  27.64 
 
 
133 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  30.77 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  27.91 
 
 
172 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  26.67 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  29.47 
 
 
171 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  30.21 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  31.78 
 
 
228 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.11 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  29.03 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  30.88 
 
 
247 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  23.4 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  30.12 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  23.4 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  23.4 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  30.85 
 
 
154 aa  41.6  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  25.84 
 
 
185 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  22.32 
 
 
144 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.26 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  32.29 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.7 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  30.23 
 
 
165 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  26.04 
 
 
162 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  28.28 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.08 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.08 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.08 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  34.12 
 
 
220 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  30.38 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  32.18 
 
 
270 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>