102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1831 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  4e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  64.39 
 
 
154 aa  150  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  74.67 
 
 
75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  49.12 
 
 
149 aa  106  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  43.45 
 
 
152 aa  106  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  39.83 
 
 
148 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  41.73 
 
 
148 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  41.53 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  43.59 
 
 
164 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  44.34 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  35.97 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  38.52 
 
 
129 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  35.97 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  37.12 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  35.83 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  34.75 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  34.75 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  33.59 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  38.28 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  39.29 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  34.68 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  37.93 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  37.07 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  35.78 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  33.64 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  34.29 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  34.85 
 
 
140 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  44.05 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  31.82 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  53.85 
 
 
69 aa  60.1  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  35.48 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  36.63 
 
 
120 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  30.7 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  29.91 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.41 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  24.48 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  29.25 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  27.52 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  24.81 
 
 
133 aa  52  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.21 
 
 
187 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  29.91 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  29.2 
 
 
137 aa  50.8  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 
116 aa  50.8  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  26.73 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  24.27 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  26.73 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  35 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  31.25 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  25.55 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  26.73 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  30.3 
 
 
183 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  31.36 
 
 
173 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  30.3 
 
 
184 aa  48.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  26.89 
 
 
197 aa  47.8  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  27.87 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  26.12 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  30.23 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  22.55 
 
 
132 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
218 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  22.5 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  25.37 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  26.44 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.97 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  25.5 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  25.29 
 
 
142 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  25.29 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  25.29 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  28.18 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  32.98 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  29.29 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  22.79 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  29.25 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  31.13 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.18 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  24.8 
 
 
191 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  32.98 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  32.98 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  26.67 
 
 
145 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  25 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  23.45 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  28.28 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  28.12 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  26.97 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  27.68 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  29.81 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  26.79 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.72 
 
 
122 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  27.72 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  27.83 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  25 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  21.7 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  27.83 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  28.7 
 
 
135 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>