97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3137 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  268  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  38.17 
 
 
185 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  40.83 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  40.83 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  40.83 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  43.86 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  47.06 
 
 
113 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  41.18 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  42.34 
 
 
136 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  42.34 
 
 
138 aa  89.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  41.18 
 
 
115 aa  86.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  38.05 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  34.38 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  40.4 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  38.24 
 
 
121 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  35.05 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  31.82 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0548  hypothetical protein  36.08 
 
 
195 aa  67  0.00000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1066  protein of unknown function DUF583  34.34 
 
 
135 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  25.86 
 
 
125 aa  61.6  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  31.53 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  29.17 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  30.43 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  29.46 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  30.1 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  31.78 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  30.84 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 
187 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.71 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  31.37 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  28.28 
 
 
203 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.51 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  32.08 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  24.41 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.09 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  29.41 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  30.77 
 
 
195 aa  51.6  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  36.56 
 
 
131 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  27.47 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  28.28 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  26.6 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  27.47 
 
 
131 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28 
 
 
148 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  32.26 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  28.28 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  27.55 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  28.3 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
128 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  27.55 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  24.79 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  26.21 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  24.58 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  28.69 
 
 
145 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  29.21 
 
 
133 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  32.22 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  27.17 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  26.8 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  30.68 
 
 
196 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  26.53 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  34.29 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  26.67 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  25.27 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2505  hypothetical protein  30.26 
 
 
129 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3570  hypothetical protein  25.51 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  27 
 
 
202 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  23.53 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3636  protein of unknown function DUF583  25.51 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.641699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  26.97 
 
 
154 aa  44.3  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  29.25 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3710  protein of unknown function DUF583  25.51 
 
 
179 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  26.67 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  30.19 
 
 
184 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0236  hypothetical protein  24.73 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  30 
 
 
199 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.17 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  28.43 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  23.96 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  29.46 
 
 
220 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  25 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  25 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  21.77 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  21.77 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  26.27 
 
 
160 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  25.97 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  29.07 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2478  hypothetical protein  29.09 
 
 
203 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  25.84 
 
 
282 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.511119 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>