138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1040 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  100 
 
 		 134 aa  254  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  63.03 
 
 		 131 aa  150  4e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  57.98 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  57.98 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  46.85 
 
 		 137 aa  103  7e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  42.4 
 
 		 130 aa  101  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  40 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  37.39 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  37.72 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  39.18 
 
 		 228 aa  73.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  32.26 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  34.95 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  31.5 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  36.05 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  39.18 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  29.57 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.83 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  31.43 
 
 		 128 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  31.78 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  37.93 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  25.21 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  31.91 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  28.99 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  33.33 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  30.85 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  34.27 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.03 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  27.97 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  32.56 
 
 		 102 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  29.79 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  28.3 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  28.72 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  30.91 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  32.11 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  29.29 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  23.53 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  23.53 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  27.54 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  27.19 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  30.23 
 
 		 265 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  27.19 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  23.53 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2201  hypothetical protein  31.91 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  28.81 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  27.73 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  34.04 
 
 		 267 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  26.53 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  29.03 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  27.88 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  27.66 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  30.85 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  28.81 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  34.04 
 
 		 270 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  29.81 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  28.36 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  26.53 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  26.53 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  33.03 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  25.64 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  31.31 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.71 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  34.04 
 
 		 269 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  34.34 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  25.64 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  25.64 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  27.97 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  30.69 
 
 		 149 aa  50.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  28.41 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  23.26 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  28 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  27.62 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  31.48 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  27.59 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  25.37 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  26.32 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  27.87 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  27.87 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  32.89 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  25.81 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  25.64 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  25.89 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  25.22 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1707  hypothetical protein  30.84 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.195534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  26.97 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  22.5 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>