111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0369 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  100 
 
 
134 aa  268  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  99.25 
 
 
134 aa  266  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  93.28 
 
 
134 aa  257  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  62.69 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  62.2 
 
 
164 aa  159  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  55.73 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  53.44 
 
 
132 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  53.44 
 
 
132 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  54.55 
 
 
140 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  50.38 
 
 
133 aa  138  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  51.13 
 
 
134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0652  hypothetical protein  51.82 
 
 
133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.963e-18  normal  0.260408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  51.91 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  58.65 
 
 
118 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0557  hypothetical protein  52.83 
 
 
141 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.234659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  46.55 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  40.48 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  44.54 
 
 
129 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  40.68 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  40.68 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  41.53 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  37.84 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  40.78 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  36.36 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  35.25 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  45.78 
 
 
100 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  34.75 
 
 
145 aa  77.4  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  36.04 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6068  protein of unknown function DUF583  34.65 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.419888  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  35.29 
 
 
138 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  30.83 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  31.06 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  33.64 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  38.46 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2198  hypothetical protein  34.85 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4500  hypothetical protein  33.66 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0597  hypothetical protein  31.48 
 
 
121 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000358877  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  30.3 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  29.82 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  34.65 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  30.3 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4353  hypothetical protein  31.68 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.671855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4489  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4508  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  27.35 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  31.43 
 
 
195 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.79 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  37.37 
 
 
184 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  34 
 
 
187 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  26.55 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  26.24 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  29.7 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  30.19 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.2 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  29.2 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  32.67 
 
 
133 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  27.2 
 
 
133 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  31.68 
 
 
185 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  25.24 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  32.18 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4993  hypothetical protein  34.29 
 
 
135 aa  51.2  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.37273  normal  0.0451267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  31.75 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.88 
 
 
122 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02947  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.597384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  28.3 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  31.48 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  29.9 
 
 
223 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0111  hypothetical protein  34.09 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25.74 
 
 
173 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  35 
 
 
348 aa  47.4  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  26.96 
 
 
137 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  25.81 
 
 
159 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  25.74 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3947  protein of unknown function DUF583  35.11 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.137705  normal  0.574303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  28.7 
 
 
139 aa  45.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  30.61 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  28.09 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  25.74 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  25.74 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  28.18 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  30 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  30.77 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  30.43 
 
 
152 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.3 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 
125 aa  43.9  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  24.35 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  24.56 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  24 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  29 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  28.89 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  27.08 
 
 
197 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1271  protein of unknown function DUF583  25.74 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.385232  normal  0.476408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  23.48 
 
 
148 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  23.48 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  29.2 
 
 
265 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  26.19 
 
 
131 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>