62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3256 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3256  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  541  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0923  protein of unknown function DUF583  42.72 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.364799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0899  hypothetical protein  47.8 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0933  hypothetical protein  47.37 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0871  hypothetical protein  46.2 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3101  hypothetical protein  46.2 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0840  hypothetical protein  38.26 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.332372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3438  hypothetical protein  46.78 
 
 		 173 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0721  cell shape determination protein CcmA  40.43 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0706  hypothetical protein  57.28 
 
 		 171 aa  137  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300244  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  116  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1711  hypothetical protein  50.98 
 
 		 135 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00527708  normal  0.712251 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2934  hypothetical protein  51.43 
 
 		 131 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000305173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  46.67 
 
 		 141 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2226  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000225435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  45.45 
 
 		 137 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  43.69 
 
 		 149 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  43.69 
 
 		 149 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  36.63 
 
 		 119 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  39.39 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  39.39 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  38.38 
 
 		 135 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  62  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  35.51 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  35.64 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  30.85 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  31.58 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  30.85 
 
 		 157 aa  53.5  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  30.23 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  28.21 
 
 		 102 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  28.8 
 
 		 166 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  29.2 
 
 		 123 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  27.66 
 
 		 183 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  26.6 
 
 		 183 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  30.23 
 
 		 131 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  29.79 
 
 		 131 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  29.35 
 
 		 113 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  36.11 
 
 		 125 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  28.92 
 
 		 159 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  24.42 
 
 		 137 aa  45.8  0.0007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3691  hypothetical protein  28.87 
 
 		 178 aa  45.4  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  31.18 
 
 		 132 aa  45.4  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  30.48 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  29.52 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0250  hypothetical protein  30.56 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  25.24 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  24.47 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3637  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 122 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.914383  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  23.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3711  protein of unknown function DUF583  29.47 
 
 		 122 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3571  hypothetical protein  29.47 
 
 		 137 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.885538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  32.98 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  27.37 
 
 		 116 aa  42.7  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  29.21 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  26.67 
 
 		 164 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  29.47 
 
 		 122 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>