35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1928 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0691  hypothetical protein  31.78 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  25.74 
 
 		 162 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  29.59 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  27.18 
 
 		 171 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  25.62 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  28.72 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  29.29 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  29.29 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  24.73 
 
 		 132 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0812  cell shape determination protein CcmA  31.58 
 
 		 191 aa  48.5  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  27.43 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  26.21 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  24.11 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  34.44 
 
 		 159 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  25.24 
 
 		 133 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.1 
 
 		 144 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1066  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2060  protein of unknown function DUF583  33.33 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1758  hypothetical protein  24.27 
 
 		 145 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0573572  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  30.3 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2825  protein of unknown function DUF583  28.42 
 
 		 113 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  25.51 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  29.59 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.16 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  21.82 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  27.18 
 
 		 122 aa  42.4  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  27.78 
 
 		 138 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  27.62 
 
 		 130 aa  42  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  22.22 
 
 		 247 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>