36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2700 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0798  hypothetical protein  67.96 
 
 		 185 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.188487  normal  0.0126197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  48.73 
 
 		 183 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  49.67 
 
 		 185 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1801  hypothetical protein  58.26 
 
 		 185 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  51.39 
 
 		 171 aa  141  6e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  63.73 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  60.78 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  64 
 
 		 221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  63 
 
 		 184 aa  138  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  63 
 
 		 184 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  62.24 
 
 		 186 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0151  hypothetical protein  43.94 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  44.12 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1308  protein of unknown function DUF583  33.1 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.677275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2023  hypothetical protein  38.3 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0159  protein of unknown function DUF583  31.65 
 
 		 113 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  30.09 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  28.46 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1928  hypothetical protein  23.68 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.284182 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  30.09 
 
 		 119 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  26.8 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  29.2 
 
 		 119 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1585  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.397214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  26.12 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  25.44 
 
 		 159 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  30.3 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  30.3 
 
 		 139 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1444  hypothetical protein  33.96 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000522592  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  28.81 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  24.43 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  26.96 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  27.54 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  28.42 
 
 		 158 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  28.04 
 
 		 144 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>