69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3818 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  237  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  94.12 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  94.12 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  36.84 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.73 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  34.21 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  33.04 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  34.41 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  32.74 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  35.63 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  37.39 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  29.66 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  30.39 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  24.77 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  30.63 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  34.74 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  31.03 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  29.7 
 
 		 185 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  27.52 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  28.72 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  35.29 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  32.17 
 
 		 165 aa  51.6  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.07 
 
 		 145 aa  51.2  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  26.6 
 
 		 220 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  30.09 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.3 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  29.7 
 
 		 184 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  28.71 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  29.79 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  28.16 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  28.16 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  25.45 
 
 		 203 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  29.79 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  33.98 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  47  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  28.28 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  30.39 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  29.2 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  24.75 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  27.43 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  27.68 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  28 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  28.05 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5104  protein of unknown function DUF583  31.96 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.332211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  31.63 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1453  hypothetical protein  31.18 
 
 		 212 aa  42.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1052  hypothetical protein  30.12 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  23.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  26.17 
 
 		 195 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  30.61 
 
 		 140 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  26.67 
 
 		 148 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  25.71 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  27.45 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  25 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  27.62 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  23.21 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3692  hypothetical protein  30.84 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0882809  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>