69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3835 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3530  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3835  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  235  1e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3818  hypothetical protein  94.12 
 
 		 119 aa  226  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  36.73 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0024  hypothetical protein  33.68 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0202286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  33.02 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  37.25 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  33.91 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  33.91 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  33.91 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  35.48 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  31.53 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03025  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.540862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3966  hypothetical protein  36.52 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.359315  normal  0.361845 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4039  hypothetical protein  29.63 
 
 		 120 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  31.91 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3273  hypothetical protein  25.69 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.666049  normal  0.894626 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  28.44 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1716  hypothetical protein  31.37 
 
 		 202 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0478971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2530  hypothetical protein  31.62 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5284  protein of unknown function DUF583  31.53 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  28.72 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4474  hypothetical protein  34.31 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0290  hypothetical protein  30.3 
 
 		 185 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0430  hypothetical protein  30.69 
 
 		 183 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0688488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1101  hypothetical protein  25.53 
 
 		 220 aa  50.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  27.12 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  34.74 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1347  hypothetical protein  30.43 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  30.1 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3896  hypothetical protein  30.69 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  30.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2700  hypothetical protein  30.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  29.31 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01740  hypothetical protein  29.73 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0600  hypothetical protein  29.13 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.296784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0579  protein of unknown function DUF583  29.13 
 
 		 184 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  29.41 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4081  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  27.72 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0935  protein of unknown function DUF583  25.45 
 
 		 203 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  28.32 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  26.32 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0746  hypothetical protein  28.28 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.72 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  27.68 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  28.32 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  24.75 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1225  protein of unknown function DUF583  26.8 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1402  protein of unknown function DUF583  32.22 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.937379  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0402  protein of unknown function DUF583  29.41 
 
 		 144 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.028528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1454  protein of unknown function DUF583  28.04 
 
 		 195 aa  44.3  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  27 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  27.59 
 
 		 228 aa  44.3  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1888  hypothetical protein  29.41 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000131762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  22.86 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  28.83 
 
 		 154 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 		 106 aa  42  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1453  hypothetical protein  30 
 
 		 212 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  25.21 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  25 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  23.21 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  24.19 
 
 		 144 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  27.83 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  27.83 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  25.71 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0308  protein of unknown function DUF583  28.57 
 
 		 152 aa  40  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000311103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>