15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02948 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02948  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.819197  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  64.29 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1831  hypothetical protein  53.85 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1764  hypothetical protein  53.85 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.765709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  49.02 
 
 
140 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  49.02 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  41.79 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  47.92 
 
 
136 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2409  cell shape determination protein CcmA  39.29 
 
 
152 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0441319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1045  hypothetical protein  32.84 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0689832  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0059  hypothetical protein  38 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0162758  normal  0.370913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0693  hypothetical protein  48.65 
 
 
148 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  47.22 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0653  hypothetical protein  42.22 
 
 
129 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  47.83 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>