16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5271 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1630  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5271  protein of unknown function DUF583  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.086995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6794  hypothetical protein  45.16 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.144647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6225  hypothetical protein  48.78 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0551295  normal  0.629644 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3702  protein of unknown function DUF583  30.58 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0346  protein of unknown function DUF583  34.17 
 
 		 348 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  31.09 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  28.07 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  31.36 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  30.36 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5092  hypothetical protein  29.13 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  32.98 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  27.19 
 
 		 137 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  26.92 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  32.74 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>