187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0966 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  163  6.9999999999999995e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  45.83 
 
 		 274 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  45.83 
 
 		 274 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  49.3 
 
 		 278 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3114  hypothetical protein  46.48 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.936734  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  47.95 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  44.29 
 
 		 284 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3435  putative UspA stress protein  47.89 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.52884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5579  UspA domain protein  47.95 
 
 		 278 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.961326 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0706  hypothetical protein  49.35 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2429  universal stress protein family protein  49.35 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  46.15 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  47.95 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1231  universal stress family protein  49.35 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.709922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1157  universal stress family protein  49.35 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  41.67 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  43.66 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  41.25 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1024  universal stress protein UspA  45.71 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  48.05 
 
 		 278 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  49.3 
 
 		 279 aa  67  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5581  UspA domain protein  46.48 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0952  universal stress protein UspA  40.85 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.511261  normal  0.862568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1732  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582534  normal  0.0358146 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  47.89 
 
 		 275 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2546  hypothetical protein  40 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.809091 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  45.31 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  45.31 
 
 		 279 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4937  UspA domain-containing protein  44.12 
 
 		 279 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.144949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  40.85 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  45.83 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_004310  BR1047  hypothetical protein  43.48 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0697  universal stress protein  41.43 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2352  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1012  hypothetical protein  43.48 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1305  UspA domain protein  37.5 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0185  hypothetical protein  44.93 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  40.26 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1135  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2880  UspA domain-containing protein  41.67 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  40.28 
 
 		 277 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5815  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.123141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 		 282 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.298494 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1339  hypothetical protein  44.29 
 
 		 280 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 276 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  38.89 
 
 		 277 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  45.95 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1555  UspA domain protein  45.95 
 
 		 270 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3129  UspA domain protein  40.79 
 
 		 294 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.131964  normal  0.194874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1355  UspA domain-containing protein  45.95 
 
 		 313 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4210  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  40.85 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  34.72 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0017  hypothetical protein  44.78 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0334555  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2134  UspA domain-containing protein  42.03 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  41.43 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  37.5 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  38.03 
 
 		 277 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  38.36 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  42.03 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2305  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  42.65 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3179  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 279 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.983564  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1452  UspA domain protein  38.57 
 
 		 282 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5814  UspA domain-containing protein  53.19 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.128092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1592  UspA domain protein  40.58 
 
 		 280 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.757336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6199  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 277 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320687  normal  0.442079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6135  UspA domain protein  40 
 
 		 270 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  40.85 
 
 		 279 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  40 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0423  UspA domain protein  40 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.892038  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5900  UspA domain-containing protein  41.1 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556152  normal  0.106065 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  33.33 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1035  universal stress protein UspA  43.06 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0939  UspA domain-containing protein  40.28 
 
 		 287 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.799371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3814  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.360617  normal  0.615146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  43.66 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2454  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821699  normal  0.675849 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  39.44 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  42.25 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0489  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4282  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.132109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1733  UspA domain protein  32.39 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  38.03 
 
 		 280 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2599  UspA domain-containing protein  39.44 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0097  UspA domain protein  41.67 
 
 		 271 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2974  UspA domain-containing protein  33.77 
 
 		 266 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.206792  normal  0.319712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4817  UspA domain protein  41.67 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0440  UspA domain-containing protein  35.21 
 
 		 272 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713184  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>