241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4797 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4145  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1571  Sel1 repeat-containing protein  99.49 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4797  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3371  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6260  Sel1 domain-containing protein  99.49 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6736  Sel1 domain-containing protein  98.46 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2885  hypothetical protein  94.36 
 
 		 195 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5148  Sel1 domain-containing protein  92.31 
 
 		 195 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3305  Sel1 domain-containing protein  90.77 
 
 		 195 aa  305  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116272  decreased coverage  0.00327996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0325  Sel1 domain protein repeat-containing protein  72.31 
 
 		 193 aa  281  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  52.31 
 
 		 219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0958  hypothetical protein  55.62 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0636  hypothetical protein  64.63 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0786  hypothetical protein  66.18 
 
 		 73 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0798  hypothetical protein  64.71 
 
 		 73 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1719  Sel1  60 
 
 		 60 aa  77  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000210899  unclonable  0.000000190842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  43.68 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.61 
 
 		 831 aa  65.1  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  34.71 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.91 
 
 		 272 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  39.13 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  43.66 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.71 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.86 
 
 		 489 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.26 
 
 		 684 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  39.33 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.71 
 
 		 2413 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.28 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  36.59 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.65 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  43.37 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1037 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  36.45 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.25 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  38.27 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.29 
 
 		 1344 aa  54.7  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  38.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  38.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1402 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.82 
 
 		 256 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 		 850 aa  53.9  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 528 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  29.58 
 
 		 490 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 565 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.57 
 
 		 270 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.53 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  33.01 
 
 		 115 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 318 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.27 
 
 		 132 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.67 
 
 		 838 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  34.31 
 
 		 817 aa  52.4  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  41.1 
 
 		 509 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  41.1 
 
 		 509 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  35.29 
 
 		 731 aa  51.6  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  41.1 
 
 		 509 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  41.79 
 
 		 789 aa  51.6  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  36.92 
 
 		 647 aa  51.6  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.67 
 
 		 252 aa  51.2  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  41.1 
 
 		 509 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.94 
 
 		 348 aa  51.2  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 		 485 aa  51.2  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.04 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  35.44 
 
 		 942 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  40.79 
 
 		 301 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  36.78 
 
 		 557 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  39.47 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.97 
 
 		 811 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  41.76 
 
 		 795 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1101  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 		 356 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0126801  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 341 aa  50.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2395  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.24 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4119  Sel1 domain-containing protein  29.2 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.2 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.2 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  32.95 
 
 		 380 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.89 
 
 		 997 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  37.29 
 
 		 1602 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  32.04 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  34.52 
 
 		 264 aa  48.9  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0453  hypothetical protein  35.63 
 
 		 329 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1896  Sel1 domain-containing protein  34.29 
 
 		 591 aa  48.5  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000746321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1160 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1992  hypothetical protein  36.67 
 
 		 438 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  32.22 
 
 		 245 aa  48.5  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1493 aa  48.5  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.97 
 
 		 294 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 382 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  32.97 
 
 		 294 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  29.73 
 
 		 376 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  34.83 
 
 		 961 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>