More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0597 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0325  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.4 
 
 		 193 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6736  Sel1 domain-containing protein  54.65 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1571  Sel1 repeat-containing protein  53.04 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6260  Sel1 domain-containing protein  53.04 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4797  Sel1 repeat-containing protein  53.49 
 
 		 195 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4145  Sel1 domain-containing protein  53.49 
 
 		 195 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3371  Sel1 domain-containing protein  53.49 
 
 		 195 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2885  hypothetical protein  53.49 
 
 		 195 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5148  Sel1 domain-containing protein  54.71 
 
 		 195 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3305  Sel1 domain-containing protein  55.49 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116272  decreased coverage  0.00327996 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0958  hypothetical protein  42.44 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0636  hypothetical protein  54.88 
 
 		 188 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1719  Sel1  63.33 
 
 		 60 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000210899  unclonable  0.000000190842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  34.95 
 
 		 2413 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  39.45 
 
 		 303 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40.38 
 
 		 425 aa  67  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  35.59 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  43.04 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  35.09 
 
 		 684 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.86 
 
 		 1402 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  42.5 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  30.94 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 489 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1037 aa  62  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 		 132 aa  62  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.37 
 
 		 831 aa  61.6  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.17 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.77 
 
 		 528 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  37.93 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  37.08 
 
 		 789 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.74 
 
 		 811 aa  59.3  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.21 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  36 
 
 		 838 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.32 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  41.46 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  41.46 
 
 		 490 aa  58.5  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.93 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  37.5 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  39.58 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  37.17 
 
 		 850 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.07 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  29.27 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  37.08 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  38.89 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  39.58 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  29.27 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.78 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  36.9 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  36.9 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  35.51 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.45 
 
 		 865 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  30.34 
 
 		 817 aa  56.2  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0786  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.21 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3565  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 418 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1512  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 890 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.522788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0798  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2903  hypothetical protein  35.8 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  42.31 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.46 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.71 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  29.81 
 
 		 913 aa  55.1  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.15 
 
 		 961 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  37.21 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 		 763 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0479  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 		 497 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.88 
 
 		 270 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0153  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  43.59 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  36.08 
 
 		 509 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.08 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  34.09 
 
 		 376 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1290  hypothetical protein  42.65 
 
 		 1602 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.450967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 		 496 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0485  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 		 497 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791443 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1493 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.33 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  30.63 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0540  tetratricopeptide repeat protein  37.76 
 
 		 497 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.653123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  37.86 
 
 		 260 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  38.46 
 
 		 552 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  34.09 
 
 		 376 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.93 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  39.77 
 
 		 384 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  37.93 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  38.27 
 
 		 256 aa  53.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 		 382 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  39.78 
 
 		 503 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 997 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  38.1 
 
 		 722 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  38.1 
 
 		 722 aa  52  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0814  hypothetical protein  37.23 
 
 		 350 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>