292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0814 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0814  hypothetical protein  100 
 
 		 350 aa  717    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003730  hypothetical protein  33.03 
 
 		 324 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0962758  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02059  hypothetical protein  34.52 
 
 		 326 aa  156  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1674  hypothetical protein  23.69 
 
 		 338 aa  77.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  31.79 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  35.04 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.04 
 
 		 811 aa  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  31.88 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  32.33 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 831 aa  64.3  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.79 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.37 
 
 		 490 aa  63.2  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.04 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 557 aa  62.8  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  34.19 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.63 
 
 		 490 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  35.45 
 
 		 156 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  36.54 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  30.86 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  33.33 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  34.82 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1032 aa  60.1  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.09 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0043  Sel1  32.79 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.521433  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  32.54 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0373  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.784905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1493 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  27.27 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  29.91 
 
 		 218 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.23 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  37.35 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  29.32 
 
 		 685 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  29.85 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0106  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  29.91 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  36.54 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2060  Sel1 domain-containing protein  29.49 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  36.54 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.54 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  57  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.33 
 
 		 264 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.88 
 
 		 225 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  34.15 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  27.97 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2569  Sel1 domain-containing protein  31 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.16 
 
 		 392 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.71 
 
 		 172 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4151  Sel1 domain-containing protein  29.6 
 
 		 365 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216978  normal  0.586602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  36.43 
 
 		 380 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  36.54 
 
 		 285 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  34.4 
 
 		 482 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04700  hypothetical protein  35.37 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  31.71 
 
 		 159 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 976 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.52 
 
 		 528 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  38.16 
 
 		 850 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 270 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09250  tetratricopeptide TPR-like helical protein  35 
 
 		 181 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  29.66 
 
 		 839 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  35.05 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2486  Sel1 domain-containing protein  33.04 
 
 		 688 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.172439  normal  0.868366 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  32.63 
 
 		 274 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0066  Sel1 repeat-containing protein  29.86 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.79 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  36.17 
 
 		 1430 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0432  hypothetical protein  29.55 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3112  Sel1 domain-containing protein  32.32 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.73458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 		 1475 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  24.12 
 
 		 255 aa  53.9  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1402 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  30.65 
 
 		 680 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  28.47 
 
 		 464 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0117  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 271 aa  53.9  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0117  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  31.97 
 
 		 293 aa  53.5  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  30.97 
 
 		 720 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  30.97 
 
 		 720 aa  53.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  27.91 
 
 		 838 aa  53.5  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2103  Sel1 domain-containing protein  36.73 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0952151  normal  0.0177116 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  30.97 
 
 		 720 aa  53.5  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0496  tetratricopeptide repeat family protein  30.69 
 
 		 615 aa  53.1  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1107  hypothetical protein  32.63 
 
 		 935 aa  53.1  0.000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.489454 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  28.1 
 
 		 212 aa  53.1  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 258 aa  53.1  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 		 248 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  40.58 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40.58 
 
 		 509 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  33 
 
 		 250 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3011  Sel1 domain-containing protein  26.61 
 
 		 278 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  31.36 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  32.32 
 
 		 731 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4403  hypothetical protein  31.31 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>