221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3305 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3305  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116272  decreased coverage  0.00327996 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1571  Sel1 repeat-containing protein  90.26 
 
 		 195 aa  340  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6260  Sel1 domain-containing protein  90.26 
 
 		 195 aa  340  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6736  Sel1 domain-containing protein  91.28 
 
 		 195 aa  332  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2885  hypothetical protein  91.28 
 
 		 195 aa  332  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4145  Sel1 domain-containing protein  90.77 
 
 		 195 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0352019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4797  Sel1 repeat-containing protein  90.77 
 
 		 195 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3371  Sel1 domain-containing protein  90.77 
 
 		 195 aa  330  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5148  Sel1 domain-containing protein  94.36 
 
 		 195 aa  319  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0325  Sel1 domain protein repeat-containing protein  71.79 
 
 		 193 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  54.08 
 
 		 219 aa  200  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0958  hypothetical protein  56.21 
 
 		 165 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267141  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0636  hypothetical protein  64.63 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0786  hypothetical protein  69.12 
 
 		 73 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0798  hypothetical protein  67.65 
 
 		 73 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1719  Sel1  65 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000210899  unclonable  0.000000190842 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  43.68 
 
 		 425 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  40.23 
 
 		 831 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  40.45 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.78 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  35.45 
 
 		 1037 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  38.78 
 
 		 342 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.43 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  36.9 
 
 		 2413 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  38.32 
 
 		 255 aa  58.2  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  36.45 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.45 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  34.15 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  39.81 
 
 		 489 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  40.22 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.71 
 
 		 684 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0737  hypothetical protein  36.78 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1586  hypothetical protein  38.64 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0198878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2998  Sel1 domain-containing protein  36.78 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  41.25 
 
 		 393 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0668  hypothetical protein  36.78 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0675  hypothetical protein  36.78 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  30.99 
 
 		 490 aa  54.3  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0307  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.46 
 
 		 811 aa  53.9  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0472  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1796 aa  54.3  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2979  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.63 
 
 		 184 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  35.29 
 
 		 817 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.48 
 
 		 528 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  41.79 
 
 		 647 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  35.42 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  34.06 
 
 		 850 aa  52.8  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36 
 
 		 448 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1344 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  32.98 
 
 		 942 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.75 
 
 		 1402 aa  51.6  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  32.08 
 
 		 384 aa  51.6  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0448  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.153887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  34 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  30.28 
 
 		 490 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1970  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 132 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.43 
 
 		 341 aa  50.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3097  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.33 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  33.67 
 
 		 373 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1493 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  34.15 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  32.71 
 
 		 838 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  40.7 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  29.91 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  41.98 
 
 		 509 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.84 
 
 		 278 aa  50.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.97 
 
 		 329 aa  50.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  31.58 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 997 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  37.78 
 
 		 557 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  33.67 
 
 		 373 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  41.98 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0412  Sel1  33.66 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1585  Sel1 domain-containing protein  38.83 
 
 		 117 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0101919 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  39.24 
 
 		 961 aa  49.3  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  41.98 
 
 		 509 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  38.27 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1048  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.76 
 
 		 565 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.54 
 
 		 270 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  35.71 
 
 		 789 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  41.67 
 
 		 380 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.94 
 
 		 348 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.48 
 
 		 380 aa  48.5  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  43.37 
 
 		 403 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1107  Sel1 domain-containing protein  37.18 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.747543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2447  hypothetical protein  38.64 
 
 		 247 aa  48.5  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  35.56 
 
 		 376 aa  48.5  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08765  activator of chitin synthase (Eurofung)  33.33 
 
 		 807 aa  48.5  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.061785  normal  0.272195 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  40.79 
 
 		 267 aa  48.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.45 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2327  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 		 382 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.239652  normal  0.179053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 1032 aa  48.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0405  hypothetical protein  38.2 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  35.56 
 
 		 376 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1002 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>