28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1719 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1719  Sel1  100 
 
 
60 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000210899  unclonable  0.000000190842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  63.33 
 
 
219 aa  83.6  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0325  Sel1 domain protein repeat-containing protein  63.33 
 
 
193 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3305  Sel1 domain-containing protein  65 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116272  decreased coverage  0.00327996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6736  Sel1 domain-containing protein  61.67 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2885  hypothetical protein  61.67 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133832  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3371  Sel1 domain-containing protein  60 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4145  Sel1 domain-containing protein  60 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0352019  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6260  Sel1 domain-containing protein  60 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4797  Sel1 repeat-containing protein  60 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1571  Sel1 repeat-containing protein  60 
 
 
195 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5148  Sel1 domain-containing protein  61.67 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0636  hypothetical protein  53.57 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  43.64 
 
 
172 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  50 
 
 
255 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1127  Sel1 domain protein repeat-containing protein  42.86 
 
 
272 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  43.1 
 
 
393 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  41.38 
 
 
376 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  41.38 
 
 
376 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.5 
 
 
278 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2289  Sel1 repeat-containing protein  44.44 
 
 
221 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0399  Sel1 domain-containing protein  39.29 
 
 
254 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  43.64 
 
 
505 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  42.37 
 
 
503 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  42.37 
 
 
503 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  42.37 
 
 
503 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  36 
 
 
536 aa  40  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2203  Sel1 domain-containing protein  45.24 
 
 
331 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0174154  normal  0.16412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>