15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_0958 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0958  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  329  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2885  hypothetical protein  57.4 
 
 
195 aa  180  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133832  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6736  Sel1 domain-containing protein  56.8 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4797  Sel1 repeat-containing protein  55.62 
 
 
195 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3371  Sel1 domain-containing protein  55.62 
 
 
195 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127098  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4145  Sel1 domain-containing protein  55.62 
 
 
195 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0352019  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1571  Sel1 repeat-containing protein  55.62 
 
 
195 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6260  Sel1 domain-containing protein  55.62 
 
 
195 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0325  Sel1 domain protein repeat-containing protein  54.71 
 
 
193 aa  169  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5148  Sel1 domain-containing protein  56.8 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3305  Sel1 domain-containing protein  56.21 
 
 
195 aa  153  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0116272  decreased coverage  0.00327996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0786  hypothetical protein  98.63 
 
 
73 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0798  hypothetical protein  98.63 
 
 
73 aa  150  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0597  Sel1 repeat-containing protein  42.44 
 
 
219 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0636  hypothetical protein  45.12 
 
 
188 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>