More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1310 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1310  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6519  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  587  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6121  AraC family transcriptional regulator  98.24 
 
 		 284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4652  AraC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 289 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  32.81 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  31.76 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4276  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4066  transcriptional activator RhaS  25.71 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.828841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2700  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2744  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.769865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2730  AraC family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136465 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1048  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 101 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000208047  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3476  helix-turn-helix, AraC type  26.53 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 118 aa  57.4  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 539 aa  56.2  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  28.57 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.73 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 543 aa  55.8  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  32.61 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  34.02 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  28.08 
 
 		 284 aa  55.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  32.67 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  25 
 
 		 529 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  24.89 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 368 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 344 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0717  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0940778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  22.58 
 
 		 519 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  24.81 
 
 		 529 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 386 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 367 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1890  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 120 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.520011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 292 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4858  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00250208  normal  0.0726035 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3979  two component transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0198  two component transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 534 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  28.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  28.21 
 
 		 278 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 427 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  25.77 
 
 		 250 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  28.71 
 
 		 160 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2404  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4291  transcriptional activator RhaS  28.21 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2452  two component transcriptional regulator, AraC family  29.7 
 
 		 509 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0693402  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  28.21 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  28.21 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 301 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3722  helix-turn-helix domain-containing protein  23.66 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  25.55 
 
 		 306 aa  52.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4384  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  29.17 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  29.13 
 
 		 542 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  29.17 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 313 aa  52.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1440  helix-turn-helix, AraC type  28.26 
 
 		 209 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 303 aa  52.8  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  27.66 
 
 		 538 aa  52.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 322 aa  52.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.96 
 
 		 1201 aa  52.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 335 aa  52.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>