54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3476 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3476  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 256 aa  502  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6121  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6519  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1310  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 354 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  33.16 
 
 		 246 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  24 
 
 		 280 aa  49.7  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 334 aa  49.3  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  31.71 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2683  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 321 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.421098  normal  0.349304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6117  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939175  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 		 363 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 278 aa  46.2  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.43 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 281 aa  45.8  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 279 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  26.61 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  26.61 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2155  helix-turn-helix domain-containing protein  28.65 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3514  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 334 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4132  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 		 299 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0973484 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2953  helix-turn-helix domain-containing protein  30.7 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2688  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.977146  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3783  alcohol dehydrogenase  33.93 
 
 		 551 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3024  ADA regulatory protein  35.29 
 
 		 287 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.697686  normal  0.421668 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 277 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3845  AraC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 297 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4013  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6092  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391074  normal  0.394917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0475  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0515677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  36.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3994  AraC family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 275 aa  42.7  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  24.59 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 331 aa  42.4  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 297 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3569  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / transcriptional regulator Ada  32.26 
 
 		 294 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 285 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 284 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4652  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 289 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 272 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 277 aa  42  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  33 
 
 		 284 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6379  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 297 aa  42  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 356 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>