More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1048 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1048  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000208047  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  96.04 
 
 		 272 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 287 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  41.49 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2340  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.581264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 538 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 290 aa  74.7  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.29 
 
 		 537 aa  71.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 533 aa  70.5  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1915  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 775 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000415573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 760 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  34.41 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 323 aa  67.8  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 517 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 298 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3249  two component transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 531 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 546 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 513 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 1201 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1981  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 299 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.63 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 532 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  36.59 
 
 		 1340 aa  65.5  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 530 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 265 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0208  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 252 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2329  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 773 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 515 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0209  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 252 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 301 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 259 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 255 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 287 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0807  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 299 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0213  response regulator receiver  34.38 
 
 		 252 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.18 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 118 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3673  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 281 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 302 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0995  two component transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 542 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 302 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 296 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 519 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 265 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.21 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  25.27 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  24.21 
 
 		 302 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 291 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  32.35 
 
 		 1384 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  27.84 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 279 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  34.02 
 
 		 1374 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  30.21 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 306 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0207  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 252 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2141  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 298 aa  60.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3627  DNA gyrase inhibitor  28.12 
 
 		 300 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000240584  hitchhiker  0.00747313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 198 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 287 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 302 aa  60.1  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  27.84 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3137  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 548 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  32 
 
 		 507 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  23.08 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0530  transcriptional regulator, AraC family  28.42 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  23.08 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 1349 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  29.79 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  32 
 
 		 507 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>