More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6003 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_5638  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6494  ABC transporter related  99.15 
 
 		 236 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6003  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7412  ABC efflux pump, ATPase subunit  96.19 
 
 		 236 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6149  ABC transporter related  94.98 
 
 		 239 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.463374 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.59 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  50.91 
 
 		 231 aa  201  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  53.43 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  49.32 
 
 		 260 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.73 
 
 		 222 aa  191  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  43.78 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.3 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  44.83 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.55 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.95 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  42.66 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.12 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  44.09 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.66 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.16 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.5 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  41.74 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.32 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.25 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.38 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  44.95 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  42.73 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 224 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  48.15 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  49.07 
 
 		 276 aa  181  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 		 234 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  43.78 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  45.41 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  45.41 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.32 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  42.73 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 229 aa  180  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  46.36 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.58 
 
 		 247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.45 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0060  ABC transporter related  43.58 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  42.4 
 
 		 646 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  46.33 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3203  ABC transporter related  47.73 
 
 		 242 aa  178  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  45.54 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  41.67 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 228 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  51.36 
 
 		 287 aa  178  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  43.32 
 
 		 220 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  47.06 
 
 		 235 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  40 
 
 		 235 aa  177  9e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.04 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  48.64 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  41.55 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.24 
 
 		 647 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1100  ABC transporter related  43.38 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  43.12 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 		 248 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  44.24 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  45.13 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  44.24 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  41.74 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  49.77 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  43.58 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.66 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  41.82 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  44.95 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  42.01 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  44.39 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  43.78 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  42.08 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0382  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  48.4 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.86 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.86 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.48 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>