More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6149 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6149  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.463374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6494  ABC transporter related  94.56 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.87798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5638  ABC transporter related  94.98 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6003  ABC transporter related  94.98 
 
 		 236 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7412  ABC efflux pump, ATPase subunit  95.24 
 
 		 236 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.956195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29510  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  51.06 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2437  ABC transporter related  51.38 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  52.36 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03080  ABC transporter ATP-binding protein  49.77 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.953982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.7 
 
 		 225 aa  191  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.41 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  45.92 
 
 		 241 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.62 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  45.5 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 248 aa  186  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.62 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  43.58 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0493  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.352505  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.7 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.24 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0224  ABC transporter related protein  49.77 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.857812  normal  0.293836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  44.7 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  46.36 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  43.84 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  43.78 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  45.62 
 
 		 224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  44.95 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  42.66 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.33 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.83 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  45.87 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  42.66 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  43.64 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.7 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  45.62 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.24 
 
 		 647 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.12 
 
 		 227 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  45 
 
 		 224 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  48.99 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  45.41 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0748  ABC transporter related  46.36 
 
 		 227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.58 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.23 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0584  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 227 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.378842  normal  0.517504 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  44.44 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4071  ABC transporter related  48.61 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00128971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  52.05 
 
 		 287 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  46.15 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  43.12 
 
 		 238 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  48.42 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  43.64 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.32 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  44.5 
 
 		 229 aa  178  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 233 aa  178  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  40.91 
 
 		 235 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  50.23 
 
 		 243 aa  178  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  49.32 
 
 		 291 aa  178  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  178  9e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  42.66 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  43.58 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  45.74 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.5 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3157  ABC transporter related protein  49.54 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  44.71 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.71 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  45.16 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  43.69 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  45.21 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3285  ABC transporter related  44.04 
 
 		 249 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.71 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  42.47 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 646 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1647  ABC transporter related  42.92 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.204823  hitchhiker  0.000330012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  47.51 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.29 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.29 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  44.8 
 
 		 224 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  45.07 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.29 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>