More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4159 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  63.6 
 
 		 289 aa  316  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  55.94 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  52.92 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  52.49 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  54.41 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  54.41 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  55.85 
 
 		 277 aa  258  7e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  53.26 
 
 		 254 aa  258  8e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  53.67 
 
 		 255 aa  256  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  35.48 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  31.66 
 
 		 255 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  30.15 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  34 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  28.4 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  31.06 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  29.46 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  29.74 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  30.04 
 
 		 240 aa  92.8  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  31.51 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  33.77 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  30.49 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  35.56 
 
 		 362 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  29.55 
 
 		 261 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  32.74 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  30 
 
 		 261 aa  85.9  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  32.5 
 
 		 267 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1830  citrate synthase 2  33.33 
 
 		 362 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.011311 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  32.52 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4948  citrate synthase 2  33.95 
 
 		 364 aa  83.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.257238  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  28.02 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  27.91 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1476  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.73 
 
 		 382 aa  79  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.644774  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  30.97 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  29.96 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.96 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  29.17 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  33.18 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  29.17 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.03 
 
 		 382 aa  75.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  31.02 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  29.33 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  29.02 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1665  citrate synthase  30.52 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  34.06 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  29.46 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.7 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  29.86 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  24.79 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  24.77 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  29.72 
 
 		 375 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  27.8 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  29.46 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  29.46 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  30.97 
 
 		 430 aa  72.4  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  25.88 
 
 		 610 aa  72  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  24.79 
 
 		 610 aa  72  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  31.14 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  27.6 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  29.46 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1379  type II citrate synthase  26.79 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000415607  normal  0.279105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  27.6 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  28.29 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  30.19 
 
 		 375 aa  71.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  31.6 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  27.6 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  24.45 
 
 		 610 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  29.88 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2973  type II citrate synthase  26.79 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00618343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2886  type II citrate synthase  26.79 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000035086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  28.57 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  24.79 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  27.6 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  33.04 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  29.39 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  26.98 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01781  citrate synthase  30.4 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.176216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  27.89 
 
 		 423 aa  69.7  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  31.39 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.49 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.44 
 
 		 385 aa  69.7  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  27.88 
 
 		 426 aa  69.3  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  31.13 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  25.88 
 
 		 429 aa  69.3  0.00000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  24.66 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0730  citrate synthase  29.46 
 
 		 398 aa  68.9  0.00000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.554862  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02436  ATP citrate lyase, subunit 1, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10650)  25.94 
 
 		 655 aa  68.9  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1139  type II citrate synthase  27.35 
 
 		 428 aa  68.6  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2696  Citrate (Si)-synthase  27.01 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01870  Citrate synthase  28.23 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  26.45 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  27.03 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  27.47 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  28.44 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  23.5 
 
 		 610 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>