More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1039 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1039  citrate synthase  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1379  citrate synthase  63.28 
 
 		 257 aa  322  4e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6294  citrate synthase  39.76 
 
 		 302 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3119  citrate synthase  33.05 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2728  citrate synthase  32.34 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4959  citrate synthase  33.05 
 
 		 282 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4144  citrate synthase  32.78 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00479182  normal  0.482128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4826  citrate synthase  33.2 
 
 		 271 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538489  normal  0.968705 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6289  citrate synthase  37.45 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0980026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8311  citrate synthase  31.8 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0447  Citrate synthase-like protein  33.18 
 
 		 240 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000621018  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4477  citrate synthase  31.25 
 
 		 250 aa  135  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4153  citrate synthase  31.12 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.595412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4041  citrate synthase  31.12 
 
 		 284 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2128  citrate synthase  31.58 
 
 		 286 aa  132  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3867  citrate synthase  31.36 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1194  citrate synthase  33.9 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4159  citrate synthase  31.01 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4013  citrate synthase  30.04 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1832  Citrate synthase  30.12 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0399593  normal  0.514801 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2009  citrate synthase  29.44 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.884105 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6318  citrate synthase  30.84 
 
 		 249 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4697  citrate synthase  31.07 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.405969  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1313  citrate synthase  29.03 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5653  citrate synthase  34.5 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0675936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4677  citrate synthase  32.61 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2022  citrate synthase  28.94 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.275146  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4946  citrate synthase  33.18 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.094047  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5380  citrate synthase  28.35 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0986  citrate synthase  30.57 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.879919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4823  citrate synthase  28.76 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4268  citrate synthase  27.89 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0799  citrate synthase  28.76 
 
 		 261 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1258  citrate synthase  30.05 
 
 		 373 aa  92.4  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1090  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  30.99 
 
 		 610 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2276  citrate synthase  30.18 
 
 		 380 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4488  citrate synthase  27.93 
 
 		 371 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4323  citrate synthase  27.93 
 
 		 371 aa  86.3  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4335  citrate synthase  27.93 
 
 		 371 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4709  citrate synthase  27.93 
 
 		 382 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000257504 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4839  citrate synthase  27.93 
 
 		 371 aa  86.3  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4720  citrate synthase  27.93 
 
 		 382 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0534  citrate synthase  27.93 
 
 		 382 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0555246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4725  citrate synthase  27.93 
 
 		 371 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4704  citrate synthase  27.93 
 
 		 382 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842149  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4424  citrate synthase  28.91 
 
 		 371 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0837  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.86 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.531649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1752  citrate synthase  29.38 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.206255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1786  citrate synthase  29.38 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.49 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1351  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  30.58 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3278  citrate synthase  27.96 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.312589  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1523  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.81 
 
 		 379 aa  82  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.297697  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1231  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  30.74 
 
 		 610 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0045  citrate synthase  27.56 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  30.19 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0100  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.02 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  29.3 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  29.9 
 
 		 437 aa  78.6  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  29.91 
 
 		 429 aa  78.6  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  31.58 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2100  citrate synthase I  30.68 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1306  ATP citrate lyase subunit 2  29.17 
 
 		 610 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.205597  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2208  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.9 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.539974  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0797  citrate lyase, subunit 2  28.33 
 
 		 610 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6150  Citrate (Si)-synthase  27.23 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.153659 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  32.93 
 
 		 432 aa  76.3  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  33.91 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  33.54 
 
 		 425 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1062  citrate lyase, subunit 2  28.1 
 
 		 610 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  30.99 
 
 		 437 aa  75.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1393  ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase  28.33 
 
 		 610 aa  75.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.025075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.4 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2367  citrate synthase 3  29.68 
 
 		 373 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  32.16 
 
 		 428 aa  75.5  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0647  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.85 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.029125  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0622  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  25.85 
 
 		 367 aa  75.5  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0115525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2188  citrate synthase 3  29.68 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.685723  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2125  citrate synthase 3  29.68 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.306637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2348  citrate synthase 3  29.68 
 
 		 372 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0344  methylcitrate synthase  29.55 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2111  citrate synthase 3  29.95 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0715  citrate synthase  28.24 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  31.82 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  28.18 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  29.49 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2086  methylcitrate synthase  31.05 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440425  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1724  citrate synthase 3  29.41 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992858  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1189  Citrate (Si)-synthase  28.44 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.5 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  30.52 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3010  citrate synthase 3  29.22 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2315  citrate synthase 3  29.22 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2027  citrate synthase 2  28.77 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3561  Citrate (Si)-synthase  26.96 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2450  citrate synthase 3  29.22 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0697754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1658  citrate synthase  28.5 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.617148  normal  0.567466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2156  citrate synthase 3  29.22 
 
 		 373 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  30.26 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  31.92 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>